Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms