Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms