Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms