Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC34Q96HJ3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms