Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms