Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms