Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC12Q8WUD4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms