Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CARMIL3Q8ND23 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms