Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms