Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms