Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms