Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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