Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT28Q7Z3Y7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms