Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MED13LQ71F56 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms