Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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C9orf139Q6ZV77 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C9orf139Q6ZV77 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C9orf139Q6ZV77 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C9orf139Q6ZV77 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf139Q6ZV77 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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