Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL4Q6XD76 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms