Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms