Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms