Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWU4

C6orf89, Bombesin receptor-activated protein C6orf89, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf89Q6UWU4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf89Q6UWU4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf89Q6UWU4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf89Q6UWU4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf89Q6UWU4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C6orf89Q6UWU4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf89Q6UWU4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms