Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms