Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms