Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FAM78BQ5VT40 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FAM78BQ5VT40 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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