Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAT1Q5SQI0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATAT1Q5SQI0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms