Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC158Q5M9N0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms