Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q56UQ5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q56UQ5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Q56UQ5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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