Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FHOD3Q2V2M9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FHOD3Q2V2M9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms