Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMPQ1L6U9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms