Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME3Q16798 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME3Q16798 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME3Q16798 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME3Q16798 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME3Q16798 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME3Q16798 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME3Q16798 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME3Q16798 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME3Q16798 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME3Q16798 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME3Q16798 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME3Q16798 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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