Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
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