Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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