Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PCSK7Q16549 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PCSK7Q16549 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PCSK7Q16549 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PCSK7Q16549 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PCSK7Q16549 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PCSK7Q16549 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PCSK7Q16549 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PCSK7Q16549 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCSK7Q16549 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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