Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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SSX1Q16384 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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SSX1Q16384 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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SSX1Q16384 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SSX1Q16384 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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