Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms