Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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