Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SEC23BQ15437 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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SEC23BQ15437 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SEC23BQ15437 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SEC23BQ15437 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SEC23BQ15437 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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SEC23BQ15437 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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SEC23BQ15437 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC23BQ15437 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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