Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCOLCEQ15113 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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