Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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