Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCA4Q14CN2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms