Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS1Q14691 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS1Q14691 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS1Q14691 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS1Q14691 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS1Q14691 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS1Q14691 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS1Q14691 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS1Q14691 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS1Q14691 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS1Q14691 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GINS1Q14691 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS1Q14691 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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