Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms