Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms