Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms