Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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