Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP140Q13342 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP140Q13342 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP140Q13342 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP140Q13342 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP140Q13342 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP140Q13342 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP140Q13342 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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