Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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