Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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