Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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