Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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PTPRJQ12913 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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PTPRJQ12913 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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