Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH17Q12864 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH17Q12864 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH17Q12864 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH17Q12864 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH17Q12864 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH17Q12864 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH17Q12864 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH17Q12864 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH17Q12864 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH17Q12864 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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