Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TROQ12816 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TROQ12816 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TROQ12816 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TROQ12816 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TROQ12816 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TROQ12816 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TROQ12816 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TROQ12816 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TROQ12816 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TROQ12816 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TROQ12816 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TROQ12816 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TROQ12816 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TROQ12816 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TROQ12816 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TROQ12816 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TROQ12816 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TROQ12816 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TROQ12816 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TROQ12816 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TROQ12816 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TROQ12816 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TROQ12816 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TROQ12816 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TROQ12816 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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